Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN5P54829 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN5P54829 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN5P54829 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN5P54829 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN5P54829 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN5P54829 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN5P54829 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN5P54829 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN5P54829 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN5P54829 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN5P54829 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN5P54829 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN5P54829 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN5P54829 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN5P54829 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN5P54829 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN5P54829 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN5P54829 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN5P54829 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN5P54829 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN5P54829 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN5P54829 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN5P54829 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN5P54829 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN5P54829 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN5P54829 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN5P54829 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PTPN5P54829 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN5P54829 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN5P54829 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN5P54829 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN5P54829 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN5P54829 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN5P54829 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN5P54829 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PTPN5P54829 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN5P54829 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN5P54829 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN5P54829 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN5P54829 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN5P54829 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN5P54829 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN5P54829 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN5P54829 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN5P54829 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN5P54829 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN5P54829 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN5P54829 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN5P54829 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN5P54829 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN5P54829 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN5P54829 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN5P54829 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN5P54829 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN5P54829 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN5P54829 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN5P54829 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN5P54829 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN5P54829 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN5P54829 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN5P54829 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN5P54829 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN5P54829 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN5P54829 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN5P54829 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN5P54829 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN5P54829 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN5P54829 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN5P54829 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN5P54829 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN5P54829 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN5P54829 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN5P54829 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN5P54829 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN5P54829 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN5P54829 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN5P54829 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN5P54829 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN5P54829 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN5P54829 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN5P54829 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN5P54829 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN5P54829 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN5P54829 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN5P54829 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN5P54829 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN5P54829 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN5P54829 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN5P54829 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN5P54829 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN5P54829 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN5P54829 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN5P54829 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN5P54829 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN5P54829 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN5P54829 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN5P54829 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN5P54829 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN5P54829 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.3 ms