Protein–RNA interactions for Protein: P43487

RANBP1, Ran-specific GTPase-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANBP1P43487 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RANBP1P43487 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RANBP1P43487 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RANBP1P43487 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RANBP1P43487 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RANBP1P43487 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RANBP1P43487 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RANBP1P43487 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RANBP1P43487 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RANBP1P43487 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RANBP1P43487 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RANBP1P43487 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RANBP1P43487 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms