Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGIRP43119 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGIRP43119 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGIRP43119 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGIRP43119 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTGIRP43119 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTGIRP43119 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTGIRP43119 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTGIRP43119 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTGIRP43119 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTGIRP43119 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGIRP43119 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGIRP43119 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTGIRP43119 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTGIRP43119 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTGIRP43119 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTGIRP43119 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 305.1 ms