Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
FLT4P35916 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
FLT4P35916 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
FLT4P35916 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
FLT4P35916 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FLT4P35916 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
FLT4P35916 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
FLT4P35916 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
FLT4P35916 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
FLT4P35916 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
FLT4P35916 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
FLT4P35916 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
FLT4P35916 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
FLT4P35916 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
FLT4P35916 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
FLT4P35916 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
FLT4P35916 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
FLT4P35916 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
FLT4P35916 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
FLT4P35916 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
FLT4P35916 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
FLT4P35916 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
FLT4P35916 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
FLT4P35916 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
FLT4P35916 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
FLT4P35916 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FLT4P35916 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
FLT4P35916 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FLT4P35916 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FLT4P35916 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
FLT4P35916 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
FLT4P35916 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FLT4P35916 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FLT4P35916 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FLT4P35916 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FLT4P35916 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
FLT4P35916 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FLT4P35916 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
FLT4P35916 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
FLT4P35916 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
FLT4P35916 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
FLT4P35916 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
FLT4P35916 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
FLT4P35916 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
FLT4P35916 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
FLT4P35916 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
FLT4P35916 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
FLT4P35916 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
FLT4P35916 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
FLT4P35916 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
FLT4P35916 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
FLT4P35916 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
FLT4P35916 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
FLT4P35916 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
FLT4P35916 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
FLT4P35916 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
FLT4P35916 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
FLT4P35916 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
FLT4P35916 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
FLT4P35916 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
FLT4P35916 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
FLT4P35916 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
FLT4P35916 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
FLT4P35916 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
FLT4P35916 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
FLT4P35916 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
FLT4P35916 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
FLT4P35916 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
FLT4P35916 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
FLT4P35916 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
FLT4P35916 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
FLT4P35916 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
FLT4P35916 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
FLT4P35916 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
FLT4P35916 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
FLT4P35916 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC32.45■■■□□ 2.78
FLT4P35916 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
FLT4P35916 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
FLT4P35916 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
FLT4P35916 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
FLT4P35916 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
FLT4P35916 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
FLT4P35916 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
FLT4P35916 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
FLT4P35916 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
FLT4P35916 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
FLT4P35916 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
FLT4P35916 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
FLT4P35916 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
FLT4P35916 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
FLT4P35916 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
FLT4P35916 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
FLT4P35916 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
FLT4P35916 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
FLT4P35916 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
FLT4P35916 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
FLT4P35916 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
FLT4P35916 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
FLT4P35916 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
FLT4P35916 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms