Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCR1P32246 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCR1P32246 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCR1P32246 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCR1P32246 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCR1P32246 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCR1P32246 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCR1P32246 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCR1P32246 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCR1P32246 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCR1P32246 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCR1P32246 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCR1P32246 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCR1P32246 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCR1P32246 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCR1P32246 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCR1P32246 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCR1P32246 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCR1P32246 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCR1P32246 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCR1P32246 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCR1P32246 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCR1P32246 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCR1P32246 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCR1P32246 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCR1P32246 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCR1P32246 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCR1P32246 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCR1P32246 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCR1P32246 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCR1P32246 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCR1P32246 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCR1P32246 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCR1P32246 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCR1P32246 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCR1P32246 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCR1P32246 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCR1P32246 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCR1P32246 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCR1P32246 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCR1P32246 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCR1P32246 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCR1P32246 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCR1P32246 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCR1P32246 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCR1P32246 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCR1P32246 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCR1P32246 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCR1P32246 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCR1P32246 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCR1P32246 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCR1P32246 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCR1P32246 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCR1P32246 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCR1P32246 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCR1P32246 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCR1P32246 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCR1P32246 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCR1P32246 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCR1P32246 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCR1P32246 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCR1P32246 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCR1P32246 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCR1P32246 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCR1P32246 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCR1P32246 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCR1P32246 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCR1P32246 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCR1P32246 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCR1P32246 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CCR1P32246 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCR1P32246 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCR1P32246 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCR1P32246 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CCR1P32246 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCR1P32246 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCR1P32246 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCR1P32246 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCR1P32246 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCR1P32246 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCR1P32246 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCR1P32246 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCR1P32246 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCR1P32246 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCR1P32246 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCR1P32246 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCR1P32246 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCR1P32246 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCR1P32246 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCR1P32246 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCR1P32246 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCR1P32246 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCR1P32246 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCR1P32246 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCR1P32246 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCR1P32246 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCR1P32246 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCR1P32246 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCR1P32246 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCR1P32246 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms