Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTGFP29279 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTGFP29279 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CTGFP29279 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CTGFP29279 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTGFP29279 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTGFP29279 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTGFP29279 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTGFP29279 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTGFP29279 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTGFP29279 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTGFP29279 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CTGFP29279 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTGFP29279 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTGFP29279 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTGFP29279 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTGFP29279 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTGFP29279 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTGFP29279 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTGFP29279 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTGFP29279 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTGFP29279 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTGFP29279 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTGFP29279 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTGFP29279 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTGFP29279 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTGFP29279 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CTGFP29279 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CTGFP29279 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTGFP29279 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CTGFP29279 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTGFP29279 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTGFP29279 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTGFP29279 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CTGFP29279 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTGFP29279 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTGFP29279 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTGFP29279 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTGFP29279 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTGFP29279 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTGFP29279 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTGFP29279 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CTGFP29279 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTGFP29279 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTGFP29279 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTGFP29279 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTGFP29279 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTGFP29279 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTGFP29279 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CTGFP29279 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTGFP29279 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTGFP29279 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTGFP29279 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CTGFP29279 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTGFP29279 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CTGFP29279 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTGFP29279 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTGFP29279 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTGFP29279 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTGFP29279 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTGFP29279 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTGFP29279 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTGFP29279 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTGFP29279 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTGFP29279 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CTGFP29279 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTGFP29279 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTGFP29279 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTGFP29279 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTGFP29279 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTGFP29279 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CTGFP29279 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTGFP29279 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTGFP29279 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTGFP29279 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTGFP29279 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTGFP29279 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTGFP29279 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CTGFP29279 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTGFP29279 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTGFP29279 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTGFP29279 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTGFP29279 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTGFP29279 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTGFP29279 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTGFP29279 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTGFP29279 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTGFP29279 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTGFP29279 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTGFP29279 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTGFP29279 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CTGFP29279 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTGFP29279 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTGFP29279 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTGFP29279 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTGFP29279 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTGFP29279 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTGFP29279 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTGFP29279 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTGFP29279 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms