Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD34P28906 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD34P28906 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD34P28906 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CD34P28906 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD34P28906 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CD34P28906 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD34P28906 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD34P28906 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD34P28906 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD34P28906 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD34P28906 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD34P28906 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CD34P28906 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CD34P28906 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CD34P28906 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD34P28906 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD34P28906 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD34P28906 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD34P28906 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CD34P28906 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD34P28906 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD34P28906 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CD34P28906 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD34P28906 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD34P28906 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD34P28906 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD34P28906 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD34P28906 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD34P28906 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD34P28906 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CD34P28906 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD34P28906 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD34P28906 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD34P28906 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD34P28906 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD34P28906 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD34P28906 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD34P28906 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD34P28906 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD34P28906 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD34P28906 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD34P28906 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD34P28906 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD34P28906 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD34P28906 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD34P28906 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CD34P28906 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD34P28906 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD34P28906 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CD34P28906 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD34P28906 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD34P28906 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CD34P28906 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CD34P28906 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD34P28906 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD34P28906 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD34P28906 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CD34P28906 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD34P28906 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD34P28906 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD34P28906 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD34P28906 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD34P28906 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD34P28906 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD34P28906 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD34P28906 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD34P28906 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD34P28906 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD34P28906 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD34P28906 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD34P28906 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD34P28906 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD34P28906 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD34P28906 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD34P28906 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD34P28906 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD34P28906 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD34P28906 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CD34P28906 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD34P28906 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD34P28906 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD34P28906 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD34P28906 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD34P28906 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD34P28906 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD34P28906 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD34P28906 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD34P28906 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD34P28906 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD34P28906 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD34P28906 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD34P28906 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD34P28906 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD34P28906 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CD34P28906 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD34P28906 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD34P28906 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD34P28906 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD34P28906 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms