Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SSFA2P28290 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SSFA2P28290 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
SSFA2P28290 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SSFA2P28290 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SSFA2P28290 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SSFA2P28290 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SSFA2P28290 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SSFA2P28290 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SSFA2P28290 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SSFA2P28290 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SSFA2P28290 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SSFA2P28290 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SSFA2P28290 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SSFA2P28290 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SSFA2P28290 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
SSFA2P28290 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SSFA2P28290 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SSFA2P28290 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SSFA2P28290 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SSFA2P28290 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SSFA2P28290 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SSFA2P28290 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SSFA2P28290 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SSFA2P28290 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SSFA2P28290 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SSFA2P28290 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SSFA2P28290 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SSFA2P28290 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SSFA2P28290 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SSFA2P28290 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SSFA2P28290 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SSFA2P28290 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SSFA2P28290 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SSFA2P28290 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SSFA2P28290 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SSFA2P28290 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SSFA2P28290 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SSFA2P28290 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SSFA2P28290 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SSFA2P28290 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SSFA2P28290 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SSFA2P28290 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SSFA2P28290 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SSFA2P28290 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
SSFA2P28290 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
SSFA2P28290 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SSFA2P28290 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
SSFA2P28290 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SSFA2P28290 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SSFA2P28290 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SSFA2P28290 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SSFA2P28290 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SSFA2P28290 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SSFA2P28290 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SSFA2P28290 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SSFA2P28290 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SSFA2P28290 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms