Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMB9P28065 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMB9P28065 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PSMB9P28065 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PSMB9P28065 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PSMB9P28065 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms