Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMA1P25786 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMA1P25786 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMA1P25786 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMA1P25786 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA1P25786 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA1P25786 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA1P25786 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA1P25786 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA1P25786 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA1P25786 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMA1P25786 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA1P25786 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA1P25786 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA1P25786 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMA1P25786 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMA1P25786 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMA1P25786 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms