Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGFR4P22455 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGFR4P22455 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms