Protein–RNA interactions for Protein: P22392

NME2, Nucleoside diphosphate kinase B, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME2P22392 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME2P22392 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME2P22392 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME2P22392 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME2P22392 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME2P22392 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NME2P22392 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME2P22392 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME2P22392 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME2P22392 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME2P22392 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME2P22392 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NME2P22392 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NME2P22392 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NME2P22392 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME2P22392 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME2P22392 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NME2P22392 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME2P22392 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME2P22392 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME2P22392 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME2P22392 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME2P22392 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NME2P22392 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME2P22392 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME2P22392 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NME2P22392 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME2P22392 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME2P22392 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NME2P22392 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NME2P22392 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME2P22392 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME2P22392 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME2P22392 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME2P22392 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NME2P22392 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME2P22392 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME2P22392 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME2P22392 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME2P22392 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME2P22392 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NME2P22392 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME2P22392 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME2P22392 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME2P22392 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME2P22392 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME2P22392 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NME2P22392 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME2P22392 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME2P22392 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME2P22392 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME2P22392 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NME2P22392 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME2P22392 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME2P22392 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NME2P22392 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME2P22392 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NME2P22392 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME2P22392 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME2P22392 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME2P22392 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME2P22392 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NME2P22392 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME2P22392 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME2P22392 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NME2P22392 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME2P22392 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME2P22392 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NME2P22392 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME2P22392 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NME2P22392 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME2P22392 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME2P22392 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME2P22392 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NME2P22392 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NME2P22392 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NME2P22392 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NME2P22392 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NME2P22392 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME2P22392 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME2P22392 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NME2P22392 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME2P22392 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NME2P22392 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME2P22392 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME2P22392 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME2P22392 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NME2P22392 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME2P22392 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME2P22392 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME2P22392 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NME2P22392 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME2P22392 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME2P22392 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME2P22392 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME2P22392 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NME2P22392 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME2P22392 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME2P22392 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NME2P22392 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.9 ms