Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BCL3P20749 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BCL3P20749 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BCL3P20749 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BCL3P20749 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BCL3P20749 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BCL3P20749 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BCL3P20749 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BCL3P20749 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BCL3P20749 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BCL3P20749 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BCL3P20749 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BCL3P20749 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCL3P20749 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCL3P20749 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCL3P20749 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCL3P20749 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCL3P20749 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCL3P20749 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCL3P20749 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCL3P20749 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCL3P20749 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCL3P20749 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCL3P20749 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BCL3P20749 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCL3P20749 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCL3P20749 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCL3P20749 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCL3P20749 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCL3P20749 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCL3P20749 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCL3P20749 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCL3P20749 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCL3P20749 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCL3P20749 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BCL3P20749 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCL3P20749 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCL3P20749 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCL3P20749 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCL3P20749 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCL3P20749 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCL3P20749 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCL3P20749 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCL3P20749 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
BCL3P20749 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
BCL3P20749 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCL3P20749 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCL3P20749 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BCL3P20749 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
BCL3P20749 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCL3P20749 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCL3P20749 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
BCL3P20749 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCL3P20749 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCL3P20749 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCL3P20749 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCL3P20749 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCL3P20749 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCL3P20749 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCL3P20749 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCL3P20749 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
BCL3P20749 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
BCL3P20749 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCL3P20749 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCL3P20749 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCL3P20749 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCL3P20749 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCL3P20749 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCL3P20749 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCL3P20749 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCL3P20749 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCL3P20749 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
BCL3P20749 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCL3P20749 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCL3P20749 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCL3P20749 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCL3P20749 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCL3P20749 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCL3P20749 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
BCL3P20749 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCL3P20749 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCL3P20749 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCL3P20749 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCL3P20749 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
BCL3P20749 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCL3P20749 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCL3P20749 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCL3P20749 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCL3P20749 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCL3P20749 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
BCL3P20749 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCL3P20749 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCL3P20749 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCL3P20749 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCL3P20749 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCL3P20749 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCL3P20749 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
BCL3P20749 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BCL3P20749 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
BCL3P20749 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms