Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREB1P16220 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREB1P16220 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREB1P16220 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREB1P16220 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREB1P16220 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CREB1P16220 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CREB1P16220 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CREB1P16220 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CREB1P16220 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CREB1P16220 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CREB1P16220 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CREB1P16220 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CREB1P16220 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CREB1P16220 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CREB1P16220 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CREB1P16220 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CREB1P16220 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CREB1P16220 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CREB1P16220 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB1P16220 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB1P16220 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB1P16220 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB1P16220 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CREB1P16220 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREB1P16220 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CREB1P16220 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CREB1P16220 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CREB1P16220 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CREB1P16220 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CREB1P16220 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CREB1P16220 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CREB1P16220 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CREB1P16220 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CREB1P16220 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CREB1P16220 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CREB1P16220 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CREB1P16220 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CREB1P16220 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CREB1P16220 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB1P16220 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB1P16220 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB1P16220 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB1P16220 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB1P16220 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB1P16220 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CREB1P16220 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREB1P16220 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREB1P16220 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREB1P16220 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CREB1P16220 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CREB1P16220 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CREB1P16220 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CREB1P16220 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CREB1P16220 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CREB1P16220 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CREB1P16220 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CREB1P16220 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CREB1P16220 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CREB1P16220 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CREB1P16220 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CREB1P16220 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CREB1P16220 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CREB1P16220 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CREB1P16220 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CREB1P16220 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CREB1P16220 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CREB1P16220 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CREB1P16220 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CREB1P16220 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CREB1P16220 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CREB1P16220 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CREB1P16220 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CREB1P16220 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CREB1P16220 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CREB1P16220 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CREB1P16220 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CREB1P16220 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CREB1P16220 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CREB1P16220 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CREB1P16220 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CREB1P16220 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CREB1P16220 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CREB1P16220 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CREB1P16220 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CREB1P16220 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CREB1P16220 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CREB1P16220 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CREB1P16220 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CREB1P16220 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CREB1P16220 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CREB1P16220 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CREB1P16220 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CREB1P16220 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CREB1P16220 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CREB1P16220 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CREB1P16220 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CREB1P16220 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CREB1P16220 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB1P16220 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms