Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SKIP12755 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SKIP12755 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SKIP12755 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SKIP12755 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SKIP12755 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SKIP12755 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SKIP12755 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SKIP12755 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SKIP12755 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SKIP12755 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SKIP12755 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SKIP12755 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SKIP12755 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SKIP12755 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SKIP12755 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SKIP12755 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SKIP12755 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SKIP12755 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SKIP12755 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SKIP12755 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SKIP12755 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SKIP12755 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SKIP12755 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SKIP12755 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SKIP12755 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SKIP12755 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SKIP12755 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SKIP12755 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SKIP12755 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SKIP12755 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SKIP12755 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SKIP12755 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SKIP12755 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SKIP12755 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SKIP12755 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SKIP12755 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SKIP12755 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SKIP12755 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SKIP12755 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SKIP12755 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SKIP12755 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SKIP12755 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SKIP12755 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SKIP12755 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SKIP12755 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SKIP12755 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SKIP12755 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SKIP12755 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SKIP12755 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SKIP12755 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SKIP12755 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SKIP12755 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKIP12755 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKIP12755 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKIP12755 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKIP12755 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKIP12755 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SKIP12755 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKIP12755 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKIP12755 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SKIP12755 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SKIP12755 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SKIP12755 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SKIP12755 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SKIP12755 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SKIP12755 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKIP12755 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SKIP12755 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKIP12755 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SKIP12755 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SKIP12755 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SKIP12755 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SKIP12755 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SKIP12755 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SKIP12755 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SKIP12755 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SKIP12755 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SKIP12755 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKIP12755 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKIP12755 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKIP12755 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKIP12755 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKIP12755 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKIP12755 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SKIP12755 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SKIP12755 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SKIP12755 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SKIP12755 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SKIP12755 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SKIP12755 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SKIP12755 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKIP12755 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKIP12755 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKIP12755 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKIP12755 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SKIP12755 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKIP12755 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SKIP12755 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SKIP12755 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms