Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PCNAP12004 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNAP12004 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNAP12004 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNAP12004 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNAP12004 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNAP12004 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNAP12004 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PCNAP12004 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCNAP12004 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCNAP12004 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCNAP12004 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PCNAP12004 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCNAP12004 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PCNAP12004 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PCNAP12004 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PCNAP12004 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCNAP12004 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCNAP12004 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCNAP12004 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PCNAP12004 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNAP12004 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNAP12004 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNAP12004 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNAP12004 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNAP12004 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNAP12004 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PCNAP12004 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCNAP12004 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCNAP12004 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCNAP12004 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCNAP12004 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCNAP12004 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCNAP12004 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PCNAP12004 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCNAP12004 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PCNAP12004 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCNAP12004 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCNAP12004 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCNAP12004 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PCNAP12004 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNAP12004 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNAP12004 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNAP12004 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNAP12004 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNAP12004 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNAP12004 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNAP12004 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNAP12004 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PCNAP12004 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCNAP12004 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCNAP12004 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCNAP12004 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCNAP12004 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PCNAP12004 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCNAP12004 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCNAP12004 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCNAP12004 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCNAP12004 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCNAP12004 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PCNAP12004 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCNAP12004 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCNAP12004 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PCNAP12004 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCNAP12004 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCNAP12004 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCNAP12004 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCNAP12004 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCNAP12004 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCNAP12004 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCNAP12004 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCNAP12004 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PCNAP12004 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCNAP12004 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCNAP12004 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCNAP12004 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCNAP12004 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCNAP12004 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PCNAP12004 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCNAP12004 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PCNAP12004 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNAP12004 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNAP12004 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNAP12004 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNAP12004 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PCNAP12004 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PCNAP12004 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCNAP12004 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PCNAP12004 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNAP12004 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNAP12004 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNAP12004 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNAP12004 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNAP12004 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNAP12004 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNAP12004 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNAP12004 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNAP12004 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNAP12004 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PCNAP12004 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms