Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LAMP1P11279 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LAMP1P11279 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms