Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RARBP10826 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RARBP10826 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RARBP10826 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RARBP10826 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RARBP10826 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RARBP10826 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RARBP10826 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RARBP10826 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RARBP10826 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RARBP10826 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RARBP10826 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RARBP10826 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RARBP10826 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RARBP10826 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RARBP10826 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RARBP10826 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RARBP10826 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RARBP10826 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RARBP10826 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RARBP10826 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RARBP10826 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RARBP10826 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RARBP10826 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RARBP10826 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RARBP10826 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RARBP10826 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RARBP10826 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RARBP10826 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RARBP10826 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RARBP10826 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RARBP10826 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RARBP10826 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RARBP10826 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RARBP10826 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RARBP10826 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RARBP10826 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
RARBP10826 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RARBP10826 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RARBP10826 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RARBP10826 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
RARBP10826 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RARBP10826 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RARBP10826 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RARBP10826 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RARBP10826 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
RARBP10826 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RARBP10826 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RARBP10826 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RARBP10826 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RARBP10826 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RARBP10826 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RARBP10826 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RARBP10826 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RARBP10826 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RARBP10826 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RARBP10826 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RARBP10826 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RARBP10826 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RARBP10826 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RARBP10826 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RARBP10826 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RARBP10826 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RARBP10826 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RARBP10826 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RARBP10826 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RARBP10826 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RARBP10826 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RARBP10826 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
RARBP10826 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RARBP10826 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RARBP10826 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RARBP10826 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RARBP10826 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RARBP10826 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RARBP10826 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RARBP10826 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RARBP10826 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RARBP10826 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RARBP10826 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RARBP10826 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RARBP10826 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RARBP10826 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RARBP10826 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RARBP10826 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RARBP10826 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RARBP10826 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RARBP10826 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RARBP10826 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
RARBP10826 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RARBP10826 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RARBP10826 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RARBP10826 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RARBP10826 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
RARBP10826 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RARBP10826 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RARBP10826 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RARBP10826 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RARBP10826 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RARBP10826 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms