Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRFP10586 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRFP10586 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRFP10586 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRFP10586 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRFP10586 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRFP10586 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPRFP10586 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRFP10586 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPRFP10586 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRFP10586 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRFP10586 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPRFP10586 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PTPRFP10586 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRFP10586 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRFP10586 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRFP10586 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRFP10586 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRFP10586 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRFP10586 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRFP10586 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRFP10586 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PTPRFP10586 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms