Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM225BP0DP42 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TMEM225BP0DP42 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM225BP0DP42 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM225BP0DP42 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM225BP0DP42 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM225BP0DP42 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM225BP0DP42 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM225BP0DP42 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM225BP0DP42 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TMEM225BP0DP42 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.7■□□□□ 0.91
TMEM225BP0DP42 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
TMEM225BP0DP42 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
TMEM225BP0DP42 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM225BP0DP42 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms