Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GLI1P08151 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GLI1P08151 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GLI1P08151 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GLI1P08151 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GLI1P08151 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GLI1P08151 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GLI1P08151 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GLI1P08151 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GLI1P08151 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GLI1P08151 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GLI1P08151 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GLI1P08151 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GLI1P08151 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GLI1P08151 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GLI1P08151 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GLI1P08151 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GLI1P08151 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GLI1P08151 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLI1P08151 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLI1P08151 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GLI1P08151 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLI1P08151 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GLI1P08151 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GLI1P08151 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GLI1P08151 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GLI1P08151 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GLI1P08151 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GLI1P08151 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GLI1P08151 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
GLI1P08151 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GLI1P08151 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GLI1P08151 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GLI1P08151 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GLI1P08151 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GLI1P08151 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GLI1P08151 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GLI1P08151 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GLI1P08151 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GLI1P08151 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GLI1P08151 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GLI1P08151 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GLI1P08151 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GLI1P08151 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GLI1P08151 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GLI1P08151 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GLI1P08151 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GLI1P08151 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GLI1P08151 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
GLI1P08151 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GLI1P08151 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GLI1P08151 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GLI1P08151 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GLI1P08151 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GLI1P08151 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GLI1P08151 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
GLI1P08151 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GLI1P08151 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GLI1P08151 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GLI1P08151 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GLI1P08151 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GLI1P08151 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GLI1P08151 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GLI1P08151 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GLI1P08151 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GLI1P08151 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GLI1P08151 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GLI1P08151 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GLI1P08151 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GLI1P08151 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GLI1P08151 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GLI1P08151 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GLI1P08151 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GLI1P08151 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GLI1P08151 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GLI1P08151 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GLI1P08151 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GLI1P08151 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GLI1P08151 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GLI1P08151 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GLI1P08151 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GLI1P08151 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GLI1P08151 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GLI1P08151 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GLI1P08151 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GLI1P08151 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GLI1P08151 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GLI1P08151 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLI1P08151 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GLI1P08151 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GLI1P08151 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GLI1P08151 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GLI1P08151 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GLI1P08151 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GLI1P08151 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GLI1P08151 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLI1P08151 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLI1P08151 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLI1P08151 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GLI1P08151 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms