Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NGFRP08138 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NGFRP08138 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NGFRP08138 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NGFRP08138 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NGFRP08138 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NGFRP08138 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NGFRP08138 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NGFRP08138 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NGFRP08138 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NGFRP08138 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NGFRP08138 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NGFRP08138 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NGFRP08138 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NGFRP08138 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NGFRP08138 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NGFRP08138 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NGFRP08138 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NGFRP08138 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NGFRP08138 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NGFRP08138 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NGFRP08138 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NGFRP08138 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NGFRP08138 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NGFRP08138 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NGFRP08138 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NGFRP08138 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NGFRP08138 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NGFRP08138 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NGFRP08138 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NGFRP08138 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NGFRP08138 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NGFRP08138 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NGFRP08138 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NGFRP08138 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NGFRP08138 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NGFRP08138 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NGFRP08138 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NGFRP08138 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NGFRP08138 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NGFRP08138 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NGFRP08138 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NGFRP08138 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NGFRP08138 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NGFRP08138 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NGFRP08138 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NGFRP08138 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NGFRP08138 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NGFRP08138 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NGFRP08138 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NGFRP08138 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NGFRP08138 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NGFRP08138 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NGFRP08138 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NGFRP08138 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NGFRP08138 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NGFRP08138 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NGFRP08138 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NGFRP08138 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NGFRP08138 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NGFRP08138 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NGFRP08138 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NGFRP08138 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NGFRP08138 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NGFRP08138 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NGFRP08138 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NGFRP08138 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NGFRP08138 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NGFRP08138 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NGFRP08138 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NGFRP08138 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NGFRP08138 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NGFRP08138 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NGFRP08138 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NGFRP08138 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NGFRP08138 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NGFRP08138 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NGFRP08138 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NGFRP08138 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NGFRP08138 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NGFRP08138 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NGFRP08138 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NGFRP08138 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NGFRP08138 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NGFRP08138 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NGFRP08138 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NGFRP08138 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NGFRP08138 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NGFRP08138 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NGFRP08138 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NGFRP08138 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NGFRP08138 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NGFRP08138 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NGFRP08138 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NGFRP08138 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NGFRP08138 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NGFRP08138 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NGFRP08138 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NGFRP08138 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NGFRP08138 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms