Protein–RNA interactions for Protein: P04433

IGKV3-11, Immunoglobulin kappa variable 3-11, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-11P04433 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGKV3-11P04433 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGKV3-11P04433 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGKV3-11P04433 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGKV3-11P04433 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGKV3-11P04433 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGKV3-11P04433 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGKV3-11P04433 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGKV3-11P04433 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGKV3-11P04433 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGKV3-11P04433 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
IGKV3-11P04433 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGKV3-11P04433 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGKV3-11P04433 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IGKV3-11P04433 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGKV3-11P04433 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGKV3-11P04433 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
IGKV3-11P04433 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGKV3-11P04433 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGKV3-11P04433 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGKV3-11P04433 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGKV3-11P04433 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGKV3-11P04433 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGKV3-11P04433 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGKV3-11P04433 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGKV3-11P04433 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
IGKV3-11P04433 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGKV3-11P04433 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGKV3-11P04433 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGKV3-11P04433 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
IGKV3-11P04433 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGKV3-11P04433 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms