Protein–RNA interactions for Protein: O95970

LGI1, Leucine-rich glioma-inactivated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI1O95970 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGI1O95970 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LGI1O95970 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGI1O95970 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGI1O95970 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGI1O95970 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LGI1O95970 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
LGI1O95970 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGI1O95970 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGI1O95970 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
LGI1O95970 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGI1O95970 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGI1O95970 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGI1O95970 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGI1O95970 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGI1O95970 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGI1O95970 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LGI1O95970 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGI1O95970 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGI1O95970 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGI1O95970 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGI1O95970 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGI1O95970 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGI1O95970 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGI1O95970 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGI1O95970 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LGI1O95970 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGI1O95970 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGI1O95970 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGI1O95970 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGI1O95970 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LGI1O95970 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGI1O95970 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LGI1O95970 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGI1O95970 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGI1O95970 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGI1O95970 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGI1O95970 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGI1O95970 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGI1O95970 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGI1O95970 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGI1O95970 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGI1O95970 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGI1O95970 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGI1O95970 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LGI1O95970 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGI1O95970 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGI1O95970 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGI1O95970 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGI1O95970 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LGI1O95970 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGI1O95970 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGI1O95970 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGI1O95970 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGI1O95970 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGI1O95970 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGI1O95970 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGI1O95970 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LGI1O95970 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGI1O95970 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGI1O95970 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGI1O95970 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGI1O95970 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LGI1O95970 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LGI1O95970 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGI1O95970 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LGI1O95970 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGI1O95970 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGI1O95970 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LGI1O95970 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGI1O95970 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LGI1O95970 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGI1O95970 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGI1O95970 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGI1O95970 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGI1O95970 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGI1O95970 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGI1O95970 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGI1O95970 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LGI1O95970 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGI1O95970 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LGI1O95970 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGI1O95970 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGI1O95970 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGI1O95970 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LGI1O95970 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGI1O95970 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGI1O95970 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGI1O95970 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LGI1O95970 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGI1O95970 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGI1O95970 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGI1O95970 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGI1O95970 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGI1O95970 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LGI1O95970 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGI1O95970 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGI1O95970 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGI1O95970 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LGI1O95970 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms