Protein–RNA interactions for Protein: O95471

CLDN7, Claudin-7, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN7O95471 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLDN7O95471 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLDN7O95471 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN7O95471 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms