Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DCTN3O75935 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCTN3O75935 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCTN3O75935 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCTN3O75935 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCTN3O75935 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCTN3O75935 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCTN3O75935 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCTN3O75935 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DCTN3O75935 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCTN3O75935 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCTN3O75935 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCTN3O75935 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCTN3O75935 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCTN3O75935 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCTN3O75935 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCTN3O75935 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCTN3O75935 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCTN3O75935 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DCTN3O75935 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DCTN3O75935 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCTN3O75935 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCTN3O75935 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCTN3O75935 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCTN3O75935 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCTN3O75935 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCTN3O75935 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCTN3O75935 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCTN3O75935 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DCTN3O75935 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCTN3O75935 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DCTN3O75935 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCTN3O75935 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCTN3O75935 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCTN3O75935 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DCTN3O75935 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DCTN3O75935 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms