Protein–RNA interactions for Protein: O60882

MMP20, Matrix metalloproteinase-20, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP20O60882 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP20O60882 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP20O60882 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP20O60882 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP20O60882 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP20O60882 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP20O60882 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP20O60882 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP20O60882 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
MMP20O60882 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MMP20O60882 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP20O60882 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP20O60882 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP20O60882 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP20O60882 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP20O60882 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP20O60882 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP20O60882 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP20O60882 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP20O60882 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP20O60882 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP20O60882 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP20O60882 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP20O60882 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP20O60882 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP20O60882 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP20O60882 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP20O60882 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP20O60882 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP20O60882 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP20O60882 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP20O60882 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP20O60882 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP20O60882 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP20O60882 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP20O60882 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP20O60882 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP20O60882 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP20O60882 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MMP20O60882 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MMP20O60882 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MMP20O60882 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MMP20O60882 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP20O60882 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP20O60882 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP20O60882 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP20O60882 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP20O60882 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP20O60882 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP20O60882 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP20O60882 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP20O60882 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP20O60882 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP20O60882 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP20O60882 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP20O60882 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP20O60882 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP20O60882 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP20O60882 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP20O60882 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP20O60882 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP20O60882 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP20O60882 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP20O60882 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP20O60882 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP20O60882 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP20O60882 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP20O60882 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP20O60882 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP20O60882 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP20O60882 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP20O60882 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP20O60882 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP20O60882 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP20O60882 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP20O60882 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP20O60882 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP20O60882 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP20O60882 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP20O60882 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP20O60882 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP20O60882 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP20O60882 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP20O60882 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP20O60882 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP20O60882 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP20O60882 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP20O60882 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MMP20O60882 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP20O60882 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP20O60882 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP20O60882 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP20O60882 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP20O60882 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP20O60882 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP20O60882 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP20O60882 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP20O60882 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP20O60882 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP20O60882 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms