Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRAMEF4O60810 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF4O60810 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF4O60810 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF4O60810 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF4O60810 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF4O60810 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF4O60810 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF4O60810 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF4O60810 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF4O60810 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF4O60810 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF4O60810 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF4O60810 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF4O60810 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF4O60810 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF4O60810 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF4O60810 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF4O60810 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF4O60810 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF4O60810 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF4O60810 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF4O60810 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF4O60810 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF4O60810 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF4O60810 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF4O60810 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF4O60810 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF4O60810 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF4O60810 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF4O60810 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF4O60810 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF4O60810 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF4O60810 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF4O60810 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF4O60810 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF4O60810 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF4O60810 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF4O60810 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF4O60810 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRAMEF4O60810 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRAMEF4O60810 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRAMEF4O60810 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF4O60810 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF4O60810 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF4O60810 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF4O60810 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF4O60810 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF4O60810 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF4O60810 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF4O60810 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF4O60810 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF4O60810 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF4O60810 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF4O60810 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF4O60810 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF4O60810 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF4O60810 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF4O60810 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF4O60810 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF4O60810 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF4O60810 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF4O60810 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF4O60810 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF4O60810 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF4O60810 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF4O60810 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF4O60810 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF4O60810 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRAMEF4O60810 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF4O60810 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF4O60810 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF4O60810 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF4O60810 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRAMEF4O60810 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
PRAMEF4O60810 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF4O60810 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF4O60810 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF4O60810 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF4O60810 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRAMEF4O60810 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF4O60810 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF4O60810 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF4O60810 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF4O60810 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF4O60810 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF4O60810 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF4O60810 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF4O60810 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRAMEF4O60810 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF4O60810 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF4O60810 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF4O60810 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF4O60810 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRAMEF4O60810 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF4O60810 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF4O60810 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRAMEF4O60810 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms