Protein–RNA interactions for Protein: O60239

SH3BP5, SH3 domain-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5O60239 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SH3BP5O60239 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5O60239 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5O60239 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5O60239 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5O60239 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3BP5O60239 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3BP5O60239 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SH3BP5O60239 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3BP5O60239 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3BP5O60239 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3BP5O60239 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3BP5O60239 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SH3BP5O60239 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3BP5O60239 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3BP5O60239 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3BP5O60239 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SH3BP5O60239 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3BP5O60239 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3BP5O60239 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3BP5O60239 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3BP5O60239 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3BP5O60239 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3BP5O60239 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3BP5O60239 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3BP5O60239 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SH3BP5O60239 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3BP5O60239 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3BP5O60239 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3BP5O60239 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3BP5O60239 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3BP5O60239 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3BP5O60239 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3BP5O60239 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SH3BP5O60239 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SH3BP5O60239 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SH3BP5O60239 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3BP5O60239 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3BP5O60239 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3BP5O60239 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3BP5O60239 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3BP5O60239 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3BP5O60239 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3BP5O60239 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3BP5O60239 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3BP5O60239 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3BP5O60239 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3BP5O60239 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3BP5O60239 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3BP5O60239 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3BP5O60239 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3BP5O60239 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SH3BP5O60239 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3BP5O60239 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3BP5O60239 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3BP5O60239 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3BP5O60239 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3BP5O60239 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3BP5O60239 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3BP5O60239 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3BP5O60239 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms