Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASA4O43374 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RASA4O43374 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RASA4O43374 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RASA4O43374 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RASA4O43374 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RASA4O43374 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RASA4O43374 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RASA4O43374 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RASA4O43374 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RASA4O43374 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RASA4O43374 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RASA4O43374 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RASA4O43374 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RASA4O43374 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RASA4O43374 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RASA4O43374 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RASA4O43374 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RASA4O43374 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RASA4O43374 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RASA4O43374 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RASA4O43374 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RASA4O43374 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RASA4O43374 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RASA4O43374 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RASA4O43374 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RASA4O43374 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RASA4O43374 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASA4O43374 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASA4O43374 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASA4O43374 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASA4O43374 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RASA4O43374 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RASA4O43374 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RASA4O43374 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RASA4O43374 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RASA4O43374 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RASA4O43374 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RASA4O43374 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RASA4O43374 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RASA4O43374 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
RASA4O43374 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RASA4O43374 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
RASA4O43374 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASA4O43374 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RASA4O43374 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASA4O43374 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASA4O43374 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASA4O43374 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASA4O43374 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASA4O43374 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASA4O43374 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASA4O43374 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASA4O43374 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RASA4O43374 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RASA4O43374 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RASA4O43374 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RASA4O43374 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASA4O43374 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASA4O43374 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASA4O43374 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASA4O43374 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASA4O43374 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASA4O43374 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASA4O43374 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASA4O43374 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RASA4O43374 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RASA4O43374 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RASA4O43374 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RASA4O43374 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RASA4O43374 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RASA4O43374 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RASA4O43374 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASA4O43374 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASA4O43374 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASA4O43374 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASA4O43374 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASA4O43374 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASA4O43374 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASA4O43374 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASA4O43374 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RASA4O43374 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RASA4O43374 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RASA4O43374 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RASA4O43374 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RASA4O43374 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RASA4O43374 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RASA4O43374 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RASA4O43374 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RASA4O43374 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RASA4O43374 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RASA4O43374 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RASA4O43374 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RASA4O43374 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RASA4O43374 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RASA4O43374 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RASA4O43374 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RASA4O43374 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RASA4O43374 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RASA4O43374 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms