Protein–RNA interactions for Protein: O15379

HDAC3, Histone deacetylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC3O15379 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC3O15379 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC3O15379 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC3O15379 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC3O15379 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC3O15379 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC3O15379 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC3O15379 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC3O15379 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC3O15379 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HDAC3O15379 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC3O15379 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC3O15379 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC3O15379 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HDAC3O15379 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HDAC3O15379 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HDAC3O15379 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HDAC3O15379 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HDAC3O15379 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms