Protein–RNA interactions for Protein: O15270

SPTLC2, Serine palmitoyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC2O15270 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPTLC2O15270 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPTLC2O15270 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPTLC2O15270 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPTLC2O15270 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SPTLC2O15270 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SPTLC2O15270 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPTLC2O15270 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SPTLC2O15270 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SPTLC2O15270 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPTLC2O15270 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPTLC2O15270 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SPTLC2O15270 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SPTLC2O15270 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SPTLC2O15270 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPTLC2O15270 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SPTLC2O15270 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SPTLC2O15270 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SPTLC2O15270 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SPTLC2O15270 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SPTLC2O15270 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SPTLC2O15270 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPTLC2O15270 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPTLC2O15270 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPTLC2O15270 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPTLC2O15270 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SPTLC2O15270 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPTLC2O15270 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SPTLC2O15270 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SPTLC2O15270 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SPTLC2O15270 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SPTLC2O15270 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPTLC2O15270 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPTLC2O15270 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SPTLC2O15270 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SPTLC2O15270 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPTLC2O15270 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SPTLC2O15270 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPTLC2O15270 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPTLC2O15270 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SPTLC2O15270 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.51■■■□□ 2
SPTLC2O15270 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SPTLC2O15270 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPTLC2O15270 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPTLC2O15270 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPTLC2O15270 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPTLC2O15270 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SPTLC2O15270 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPTLC2O15270 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPTLC2O15270 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPTLC2O15270 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPTLC2O15270 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SPTLC2O15270 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPTLC2O15270 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPTLC2O15270 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPTLC2O15270 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPTLC2O15270 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPTLC2O15270 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPTLC2O15270 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SPTLC2O15270 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPTLC2O15270 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPTLC2O15270 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPTLC2O15270 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPTLC2O15270 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPTLC2O15270 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPTLC2O15270 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPTLC2O15270 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SPTLC2O15270 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPTLC2O15270 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPTLC2O15270 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPTLC2O15270 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPTLC2O15270 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPTLC2O15270 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SPTLC2O15270 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPTLC2O15270 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SPTLC2O15270 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
SPTLC2O15270 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPTLC2O15270 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPTLC2O15270 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SPTLC2O15270 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPTLC2O15270 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SPTLC2O15270 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPTLC2O15270 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPTLC2O15270 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPTLC2O15270 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPTLC2O15270 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SPTLC2O15270 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SPTLC2O15270 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPTLC2O15270 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPTLC2O15270 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPTLC2O15270 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPTLC2O15270 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPTLC2O15270 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPTLC2O15270 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPTLC2O15270 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SPTLC2O15270 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPTLC2O15270 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPTLC2O15270 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPTLC2O15270 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SPTLC2O15270 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms