Protein–RNA interactions for Protein: O15213

WDR46, WD repeat-containing protein 46, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR46O15213 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
WDR46O15213 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
WDR46O15213 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
WDR46O15213 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
WDR46O15213 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
WDR46O15213 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
WDR46O15213 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
WDR46O15213 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
WDR46O15213 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
WDR46O15213 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
WDR46O15213 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
WDR46O15213 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
WDR46O15213 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
WDR46O15213 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
WDR46O15213 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
WDR46O15213 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
WDR46O15213 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
WDR46O15213 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
WDR46O15213 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
WDR46O15213 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
WDR46O15213 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
WDR46O15213 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
WDR46O15213 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
WDR46O15213 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
WDR46O15213 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
WDR46O15213 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
WDR46O15213 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
WDR46O15213 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
WDR46O15213 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
WDR46O15213 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
WDR46O15213 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
WDR46O15213 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
WDR46O15213 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
WDR46O15213 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
WDR46O15213 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
WDR46O15213 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
WDR46O15213 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
WDR46O15213 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
WDR46O15213 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
WDR46O15213 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
WDR46O15213 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
WDR46O15213 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
WDR46O15213 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
WDR46O15213 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
WDR46O15213 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
WDR46O15213 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
WDR46O15213 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
WDR46O15213 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
WDR46O15213 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
WDR46O15213 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
WDR46O15213 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
WDR46O15213 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
WDR46O15213 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
WDR46O15213 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
WDR46O15213 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
WDR46O15213 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
WDR46O15213 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
WDR46O15213 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
WDR46O15213 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
WDR46O15213 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
WDR46O15213 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
WDR46O15213 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
WDR46O15213 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
WDR46O15213 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
WDR46O15213 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
WDR46O15213 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
WDR46O15213 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
WDR46O15213 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
WDR46O15213 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
WDR46O15213 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
WDR46O15213 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
WDR46O15213 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
WDR46O15213 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
WDR46O15213 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
WDR46O15213 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
WDR46O15213 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
WDR46O15213 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
WDR46O15213 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
WDR46O15213 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
WDR46O15213 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
WDR46O15213 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
WDR46O15213 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
WDR46O15213 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
WDR46O15213 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
WDR46O15213 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
WDR46O15213 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
WDR46O15213 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
WDR46O15213 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
WDR46O15213 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR46O15213 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR46O15213 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR46O15213 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR46O15213 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR46O15213 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR46O15213 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR46O15213 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
WDR46O15213 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
WDR46O15213 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
WDR46O15213 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
WDR46O15213 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.5 ms