Protein–RNA interactions for Protein: O15118

NPC1, Niemann-Pick C1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1O15118 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPC1O15118 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPC1O15118 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NPC1O15118 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPC1O15118 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPC1O15118 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPC1O15118 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPC1O15118 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPC1O15118 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPC1O15118 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPC1O15118 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPC1O15118 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPC1O15118 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPC1O15118 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPC1O15118 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPC1O15118 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPC1O15118 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPC1O15118 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPC1O15118 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NPC1O15118 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPC1O15118 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPC1O15118 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPC1O15118 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPC1O15118 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPC1O15118 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPC1O15118 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPC1O15118 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPC1O15118 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPC1O15118 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPC1O15118 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPC1O15118 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPC1O15118 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPC1O15118 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NPC1O15118 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NPC1O15118 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPC1O15118 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NPC1O15118 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NPC1O15118 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPC1O15118 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPC1O15118 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPC1O15118 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPC1O15118 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPC1O15118 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPC1O15118 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPC1O15118 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPC1O15118 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPC1O15118 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPC1O15118 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPC1O15118 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPC1O15118 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPC1O15118 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPC1O15118 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1O15118 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1O15118 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1O15118 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1O15118 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1O15118 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1O15118 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1O15118 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NPC1O15118 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPC1O15118 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPC1O15118 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPC1O15118 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPC1O15118 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPC1O15118 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPC1O15118 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPC1O15118 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPC1O15118 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPC1O15118 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPC1O15118 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPC1O15118 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPC1O15118 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPC1O15118 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPC1O15118 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPC1O15118 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPC1O15118 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPC1O15118 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPC1O15118 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPC1O15118 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPC1O15118 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPC1O15118 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPC1O15118 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPC1O15118 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPC1O15118 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPC1O15118 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPC1O15118 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPC1O15118 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPC1O15118 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPC1O15118 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPC1O15118 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPC1O15118 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPC1O15118 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPC1O15118 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPC1O15118 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPC1O15118 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPC1O15118 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPC1O15118 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPC1O15118 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPC1O15118 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPC1O15118 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms