Protein–RNA interactions for Protein: O14827

RASGRF2, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF2O14827 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASGRF2O14827 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASGRF2O14827 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASGRF2O14827 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASGRF2O14827 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RASGRF2O14827 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASGRF2O14827 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RASGRF2O14827 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASGRF2O14827 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RASGRF2O14827 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RASGRF2O14827 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RASGRF2O14827 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RASGRF2O14827 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RASGRF2O14827 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RASGRF2O14827 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RASGRF2O14827 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RASGRF2O14827 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASGRF2O14827 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASGRF2O14827 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASGRF2O14827 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RASGRF2O14827 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASGRF2O14827 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASGRF2O14827 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASGRF2O14827 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASGRF2O14827 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASGRF2O14827 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RASGRF2O14827 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RASGRF2O14827 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RASGRF2O14827 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RASGRF2O14827 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RASGRF2O14827 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RASGRF2O14827 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RASGRF2O14827 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RASGRF2O14827 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RASGRF2O14827 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RASGRF2O14827 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RASGRF2O14827 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RASGRF2O14827 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RASGRF2O14827 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RASGRF2O14827 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RASGRF2O14827 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RASGRF2O14827 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RASGRF2O14827 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RASGRF2O14827 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RASGRF2O14827 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RASGRF2O14827 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASGRF2O14827 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASGRF2O14827 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASGRF2O14827 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASGRF2O14827 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASGRF2O14827 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASGRF2O14827 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASGRF2O14827 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RASGRF2O14827 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms