Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GFRA2O00451 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GFRA2O00451 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GFRA2O00451 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GFRA2O00451 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GFRA2O00451 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GFRA2O00451 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GFRA2O00451 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GFRA2O00451 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GFRA2O00451 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GFRA2O00451 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GFRA2O00451 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GFRA2O00451 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GFRA2O00451 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GFRA2O00451 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GFRA2O00451 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GFRA2O00451 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GFRA2O00451 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GFRA2O00451 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GFRA2O00451 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GFRA2O00451 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GFRA2O00451 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GFRA2O00451 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GFRA2O00451 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GFRA2O00451 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GFRA2O00451 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GFRA2O00451 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GFRA2O00451 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GFRA2O00451 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GFRA2O00451 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GFRA2O00451 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GFRA2O00451 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GFRA2O00451 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GFRA2O00451 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GFRA2O00451 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GFRA2O00451 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GFRA2O00451 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GFRA2O00451 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GFRA2O00451 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GFRA2O00451 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GFRA2O00451 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GFRA2O00451 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
GFRA2O00451 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GFRA2O00451 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GFRA2O00451 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GFRA2O00451 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GFRA2O00451 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GFRA2O00451 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GFRA2O00451 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GFRA2O00451 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GFRA2O00451 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GFRA2O00451 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GFRA2O00451 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GFRA2O00451 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GFRA2O00451 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GFRA2O00451 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GFRA2O00451 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GFRA2O00451 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GFRA2O00451 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GFRA2O00451 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GFRA2O00451 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GFRA2O00451 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GFRA2O00451 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GFRA2O00451 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GFRA2O00451 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GFRA2O00451 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GFRA2O00451 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GFRA2O00451 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GFRA2O00451 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GFRA2O00451 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GFRA2O00451 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GFRA2O00451 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GFRA2O00451 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GFRA2O00451 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GFRA2O00451 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GFRA2O00451 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GFRA2O00451 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GFRA2O00451 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms