Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RFXAPO00287 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RFXAPO00287 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFXAPO00287 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFXAPO00287 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFXAPO00287 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFXAPO00287 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFXAPO00287 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RFXAPO00287 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFXAPO00287 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RFXAPO00287 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFXAPO00287 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFXAPO00287 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFXAPO00287 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFXAPO00287 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RFXAPO00287 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RFXAPO00287 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RFXAPO00287 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RFXAPO00287 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RFXAPO00287 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RFXAPO00287 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RFXAPO00287 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RFXAPO00287 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RFXAPO00287 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RFXAPO00287 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RFXAPO00287 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFXAPO00287 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFXAPO00287 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFXAPO00287 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFXAPO00287 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFXAPO00287 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFXAPO00287 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFXAPO00287 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RFXAPO00287 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFXAPO00287 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RFXAPO00287 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RFXAPO00287 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RFXAPO00287 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RFXAPO00287 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RFXAPO00287 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RFXAPO00287 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RFXAPO00287 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
RFXAPO00287 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RFXAPO00287 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RFXAPO00287 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RFXAPO00287 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RFXAPO00287 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RFXAPO00287 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFXAPO00287 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFXAPO00287 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFXAPO00287 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RFXAPO00287 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFXAPO00287 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFXAPO00287 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RFXAPO00287 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RFXAPO00287 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFXAPO00287 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFXAPO00287 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFXAPO00287 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFXAPO00287 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RFXAPO00287 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RFXAPO00287 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RFXAPO00287 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFXAPO00287 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFXAPO00287 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RFXAPO00287 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RFXAPO00287 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
RFXAPO00287 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RFXAPO00287 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RFXAPO00287 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RFXAPO00287 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RFXAPO00287 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFXAPO00287 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFXAPO00287 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFXAPO00287 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFXAPO00287 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RFXAPO00287 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFXAPO00287 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFXAPO00287 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFXAPO00287 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFXAPO00287 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFXAPO00287 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFXAPO00287 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RFXAPO00287 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
RFXAPO00287 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RFXAPO00287 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFXAPO00287 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFXAPO00287 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFXAPO00287 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RFXAPO00287 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFXAPO00287 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RFXAPO00287 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFXAPO00287 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFXAPO00287 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFXAPO00287 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFXAPO00287 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFXAPO00287 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RFXAPO00287 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFXAPO00287 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RFXAPO00287 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
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