Protein–RNA interactions for Protein: O00148

DDX39A, ATP-dependent RNA helicase DDX39A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39AO00148 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DDX39AO00148 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DDX39AO00148 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX39AO00148 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DDX39AO00148 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX39AO00148 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX39AO00148 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX39AO00148 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX39AO00148 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DDX39AO00148 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX39AO00148 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX39AO00148 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX39AO00148 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX39AO00148 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DDX39AO00148 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DDX39AO00148 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX39AO00148 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX39AO00148 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX39AO00148 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DDX39AO00148 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX39AO00148 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DDX39AO00148 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DDX39AO00148 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
DDX39AO00148 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX39AO00148 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX39AO00148 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
DDX39AO00148 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX39AO00148 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX39AO00148 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX39AO00148 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX39AO00148 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DDX39AO00148 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX39AO00148 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX39AO00148 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX39AO00148 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX39AO00148 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX39AO00148 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX39AO00148 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX39AO00148 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX39AO00148 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX39AO00148 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms