Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H7C0C1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
H7C0C1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H7C0C1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H7C0C1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H7C0C1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H7C0C1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
H7C0C1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
H7C0C1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
H7C0C1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
H7C0C1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
H7C0C1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
H7C0C1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H7C0C1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
H7C0C1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
H7C0C1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H7C0C1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H7C0C1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
H7C0C1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H7C0C1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H7C0C1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H7C0C1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H7C0C1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H7C0C1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
H7C0C1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H7C0C1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H7C0C1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
H7C0C1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H7C0C1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H7C0C1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
H7C0C1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H7C0C1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
H7C0C1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
H7C0C1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
H7C0C1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
H7C0C1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
H7C0C1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
H7C0C1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H7C0C1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H7C0C1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H7C0C1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
H7C0C1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H7C0C1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
H7C0C1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H7C0C1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
H7C0C1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H7C0C1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H7C0C1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
H7C0C1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
H7C0C1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H7C0C1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H7C0C1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
H7C0C1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
H7C0C1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
H7C0C1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
H7C0C1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
H7C0C1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H7C0C1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H7C0C1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H7C0C1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H7C0C1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H7C0C1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
H7C0C1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H7C0C1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H7C0C1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H7C0C1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H7C0C1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
H7C0C1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
H7C0C1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
H7C0C1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H7C0C1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H7C0C1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H7C0C1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H7C0C1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
H7C0C1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
H7C0C1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H7C0C1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
H7C0C1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H7C0C1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
H7C0C1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H7C0C1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H7C0C1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
H7C0C1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H7C0C1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
H7C0C1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H7C0C1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H7C0C1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H7C0C1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H7C0C1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H7C0C1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H7C0C1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H7C0C1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H7C0C1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
H7C0C1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H7C0C1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H7C0C1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H7C0C1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H7C0C1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H7C0C1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H7C0C1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms