Protein–RNA interactions for Protein: F5H4B4

FAM227A, Protein FAM227A, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227AF5H4B4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FAM227AF5H4B4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FAM227AF5H4B4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM227AF5H4B4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM227AF5H4B4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM227AF5H4B4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FAM227AF5H4B4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM227AF5H4B4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM227AF5H4B4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM227AF5H4B4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM227AF5H4B4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM227AF5H4B4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM227AF5H4B4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM227AF5H4B4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM227AF5H4B4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM227AF5H4B4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM227AF5H4B4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM227AF5H4B4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM227AF5H4B4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM227AF5H4B4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM227AF5H4B4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM227AF5H4B4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM227AF5H4B4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM227AF5H4B4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM227AF5H4B4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM227AF5H4B4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM227AF5H4B4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM227AF5H4B4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM227AF5H4B4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM227AF5H4B4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM227AF5H4B4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM227AF5H4B4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM227AF5H4B4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM227AF5H4B4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM227AF5H4B4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM227AF5H4B4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM227AF5H4B4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM227AF5H4B4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM227AF5H4B4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM227AF5H4B4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM227AF5H4B4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM227AF5H4B4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM227AF5H4B4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM227AF5H4B4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM227AF5H4B4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM227AF5H4B4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM227AF5H4B4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM227AF5H4B4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM227AF5H4B4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM227AF5H4B4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM227AF5H4B4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM227AF5H4B4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM227AF5H4B4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM227AF5H4B4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM227AF5H4B4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM227AF5H4B4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM227AF5H4B4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM227AF5H4B4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM227AF5H4B4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM227AF5H4B4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM227AF5H4B4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM227AF5H4B4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms