Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGB1P1B2RPK0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB1P1B2RPK0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB1P1B2RPK0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB1P1B2RPK0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB1P1B2RPK0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB1P1B2RPK0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB1P1B2RPK0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGB1P1B2RPK0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGB1P1B2RPK0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGB1P1B2RPK0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGB1P1B2RPK0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGB1P1B2RPK0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HMGB1P1B2RPK0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGB1P1B2RPK0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGB1P1B2RPK0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGB1P1B2RPK0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGB1P1B2RPK0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGB1P1B2RPK0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGB1P1B2RPK0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGB1P1B2RPK0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGB1P1B2RPK0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGB1P1B2RPK0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HMGB1P1B2RPK0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGB1P1B2RPK0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGB1P1B2RPK0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HMGB1P1B2RPK0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGB1P1B2RPK0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGB1P1B2RPK0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGB1P1B2RPK0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGB1P1B2RPK0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HMGB1P1B2RPK0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGB1P1B2RPK0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGB1P1B2RPK0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HMGB1P1B2RPK0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGB1P1B2RPK0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGB1P1B2RPK0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGB1P1B2RPK0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGB1P1B2RPK0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HMGB1P1B2RPK0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGB1P1B2RPK0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGB1P1B2RPK0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGB1P1B2RPK0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGB1P1B2RPK0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGB1P1B2RPK0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HMGB1P1B2RPK0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HMGB1P1B2RPK0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HMGB1P1B2RPK0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HMGB1P1B2RPK0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms