Protein–RNA interactions for Protein: A8MUH7

PDZK1P1, Putative PDZ domain-containing protein PDZK1P1, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1P1A8MUH7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PDZK1P1A8MUH7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDZK1P1A8MUH7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDZK1P1A8MUH7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDZK1P1A8MUH7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDZK1P1A8MUH7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDZK1P1A8MUH7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDZK1P1A8MUH7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDZK1P1A8MUH7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PDZK1P1A8MUH7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZK1P1A8MUH7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZK1P1A8MUH7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZK1P1A8MUH7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZK1P1A8MUH7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZK1P1A8MUH7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZK1P1A8MUH7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZK1P1A8MUH7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZK1P1A8MUH7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZK1P1A8MUH7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PDZK1P1A8MUH7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZK1P1A8MUH7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZK1P1A8MUH7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PDZK1P1A8MUH7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PDZK1P1A8MUH7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZK1P1A8MUH7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZK1P1A8MUH7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZK1P1A8MUH7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZK1P1A8MUH7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZK1P1A8MUH7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PDZK1P1A8MUH7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZK1P1A8MUH7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZK1P1A8MUH7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZK1P1A8MUH7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZK1P1A8MUH7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZK1P1A8MUH7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZK1P1A8MUH7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZK1P1A8MUH7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZK1P1A8MUH7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PDZK1P1A8MUH7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDZK1P1A8MUH7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PDZK1P1A8MUH7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms