Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOBPA7XYQ1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOBPA7XYQ1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOBPA7XYQ1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOBPA7XYQ1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOBPA7XYQ1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOBPA7XYQ1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOBPA7XYQ1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOBPA7XYQ1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOBPA7XYQ1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOBPA7XYQ1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOBPA7XYQ1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOBPA7XYQ1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOBPA7XYQ1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOBPA7XYQ1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOBPA7XYQ1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SOBPA7XYQ1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOBPA7XYQ1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SOBPA7XYQ1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOBPA7XYQ1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SOBPA7XYQ1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOBPA7XYQ1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOBPA7XYQ1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOBPA7XYQ1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SOBPA7XYQ1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOBPA7XYQ1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOBPA7XYQ1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SOBPA7XYQ1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SOBPA7XYQ1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOBPA7XYQ1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOBPA7XYQ1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOBPA7XYQ1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOBPA7XYQ1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SOBPA7XYQ1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOBPA7XYQ1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOBPA7XYQ1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOBPA7XYQ1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SOBPA7XYQ1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOBPA7XYQ1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOBPA7XYQ1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOBPA7XYQ1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOBPA7XYQ1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOBPA7XYQ1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SOBPA7XYQ1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOBPA7XYQ1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOBPA7XYQ1 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SOBPA7XYQ1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOBPA7XYQ1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOBPA7XYQ1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SOBPA7XYQ1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SOBPA7XYQ1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SOBPA7XYQ1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SOBPA7XYQ1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SOBPA7XYQ1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SOBPA7XYQ1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOBPA7XYQ1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SOBPA7XYQ1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOBPA7XYQ1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOBPA7XYQ1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOBPA7XYQ1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOBPA7XYQ1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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