Protein–RNA interactions for Protein: A6NM45

CLDN24, Putative claudin-24, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN24A6NM45 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLDN24A6NM45 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLDN24A6NM45 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN24A6NM45 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN24A6NM45 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms