Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GOLGA6L9A6NEM1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA6L9A6NEM1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA6L9A6NEM1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA6L9A6NEM1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA6L9A6NEM1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GOLGA6L9A6NEM1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA6L9A6NEM1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA6L9A6NEM1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA6L9A6NEM1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA6L9A6NEM1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA6L9A6NEM1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA6L9A6NEM1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA6L9A6NEM1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GOLGA6L9A6NEM1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GOLGA6L9A6NEM1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms