Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SEC24CP53992 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SEC24CP53992 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms