RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587989.1

TMUB2-209, Transcript of transmembrane and ubiquitin like domain containing 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 3 BASIC

Gene TMUB2, Length 1,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2-209ENST00000587989 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.76■■■■□ 3.64
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TMUB2-209ENST00000587989 NACADO15069 1562 aa31.22■■■□□ 2.59
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TMUB2-209ENST00000587989 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.14■■■□□ 2.58
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TMUB2-209ENST00000587989 SMARCA4P51532 1647 aa29.19■■■□□ 2.26
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TMUB2-209ENST00000587989 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.13■■■□□ 2.25
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TMUB2-209ENST00000587989 SMARCA2P51531 1590 aa28.89■■■□□ 2.22
TMUB2-209ENST00000587989 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.87■■■□□ 2.21
TMUB2-209ENST00000587989 WIZO95785 1651 aa28.84■■■□□ 2.21
TMUB2-209ENST00000587989 NCAPD3P42695 1498 aa28.82■■■□□ 2.2
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TMUB2-209ENST00000587989 NESP48681 1621 aa28.01■■■□□ 2.07
TMUB2-209ENST00000587989 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.96■■■□□ 2.07
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TMUB2-209ENST00000587989 ERCC6Q03468 1493 aa27.72■■■□□ 2.03
TMUB2-209ENST00000587989 PRDM2Q13029 1718 aa27.72■■■□□ 2.03
TMUB2-209ENST00000587989 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.71■■■□□ 2.03
TMUB2-209ENST00000587989 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.65■■■□□ 2.02
TMUB2-209ENST00000587989 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.62■■■□□ 2.01
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TMUB2-209ENST00000587989 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
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TMUB2-209ENST00000587989 WDR62O43379 1518 aa27.35■■□□□ 1.97
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TMUB2-209ENST00000587989 TOPBP1Q92547 1522 aa27.31■■□□□ 1.96
TMUB2-209ENST00000587989 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.3■■□□□ 1.96
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TMUB2-209ENST00000587989 SYNJ1O43426 1573 aa27.21■■□□□ 1.95
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TMUB2-209ENST00000587989 TOP2BQ02880 1626 aa27.16■■□□□ 1.94
TMUB2-209ENST00000587989 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.14■■□□□ 1.94
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TMUB2-209ENST00000587989 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
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TMUB2-209ENST00000587989 IFT140Q96RY7 1462 aa27.01■■□□□ 1.91
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TMUB2-209ENST00000587989 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
TMUB2-209ENST00000587989 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
TMUB2-209ENST00000587989 WDR97A6NE52 1622 aa26.83■■□□□ 1.88
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TMUB2-209ENST00000587989 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.72■■□□□ 1.87
TMUB2-209ENST00000587989 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
TMUB2-209ENST00000587989 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.71■■□□□ 1.87
TMUB2-209ENST00000587989 KIF27Q86VH2 1401 aa26.71■■□□□ 1.87
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TMUB2-209ENST00000587989 CHD1O14646 1710 aa26.32■■□□□ 1.8
TMUB2-209ENST00000587989 PRXQ9BXM0 1461 aa26.31■■□□□ 1.8
TMUB2-209ENST00000587989 GRIN2AQ12879 1464 aa26.29■■□□□ 1.8
TMUB2-209ENST00000587989 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.28■■□□□ 1.8
TMUB2-209ENST00000587989 OSCARQ8IYS5 282 aa26.22■■□□□ 1.79
TMUB2-209ENST00000587989 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.18■■□□□ 1.78
TMUB2-209ENST00000587989 KIF21BO75037 1637 aa26.17■■□□□ 1.78
TMUB2-209ENST00000587989 NUP160Q12769 1436 aa26.15■■□□□ 1.78
TMUB2-209ENST00000587989 CEP170Q5SW79 1584 aa26.14■■□□□ 1.77
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