Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KQE9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KQE9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KQE9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KQE9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
U3KQE9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
U3KQE9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
U3KQE9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
U3KQE9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
U3KQE9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
U3KQE9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
U3KQE9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
U3KQE9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
U3KQE9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
U3KQE9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
U3KQE9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
U3KQE9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
U3KQE9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
U3KQE9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
U3KQE9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
U3KQE9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
U3KQE9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
U3KQE9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
U3KQE9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
U3KQE9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
U3KQE9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
U3KQE9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
U3KQE9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
U3KQE9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
U3KQE9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
U3KQE9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
U3KQE9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
U3KQE9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
U3KQE9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
U3KQE9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
U3KQE9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
U3KQE9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
U3KQE9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
U3KQE9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
U3KQE9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
U3KQE9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
U3KQE9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
U3KQE9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
U3KQE9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
U3KQE9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
U3KQE9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
U3KQE9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
U3KQE9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
U3KQE9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
U3KQE9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
U3KQE9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
U3KQE9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
U3KQE9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
U3KQE9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
U3KQE9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
U3KQE9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
U3KQE9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
U3KQE9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
U3KQE9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
U3KQE9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
U3KQE9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
U3KQE9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
U3KQE9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
U3KQE9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
U3KQE9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
U3KQE9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
U3KQE9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
U3KQE9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
U3KQE9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
U3KQE9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
U3KQE9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U3KQE9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
U3KQE9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
U3KQE9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U3KQE9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
U3KQE9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
U3KQE9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
U3KQE9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
U3KQE9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
U3KQE9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
U3KQE9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
U3KQE9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
U3KQE9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
U3KQE9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
U3KQE9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
U3KQE9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
U3KQE9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
U3KQE9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
U3KQE9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
U3KQE9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
U3KQE9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
U3KQE9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
U3KQE9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
U3KQE9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
U3KQE9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U3KQE9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U3KQE9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U3KQE9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
U3KQE9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
U3KQE9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms