Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6S9

RPS6KL1, Ribosomal protein S6 kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1Q9Y6S9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPS6KL1Q9Y6S9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPS6KL1Q9Y6S9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPS6KL1Q9Y6S9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPS6KL1Q9Y6S9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPS6KL1Q9Y6S9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPS6KL1Q9Y6S9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPS6KL1Q9Y6S9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPS6KL1Q9Y6S9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPS6KL1Q9Y6S9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RPS6KL1Q9Y6S9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPS6KL1Q9Y6S9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPS6KL1Q9Y6S9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPS6KL1Q9Y6S9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPS6KL1Q9Y6S9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS6KL1Q9Y6S9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS6KL1Q9Y6S9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS6KL1Q9Y6S9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS6KL1Q9Y6S9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS6KL1Q9Y6S9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPS6KL1Q9Y6S9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPS6KL1Q9Y6S9 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPS6KL1Q9Y6S9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPS6KL1Q9Y6S9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPS6KL1Q9Y6S9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPS6KL1Q9Y6S9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPS6KL1Q9Y6S9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPS6KL1Q9Y6S9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RPS6KL1Q9Y6S9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RPS6KL1Q9Y6S9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KL1Q9Y6S9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KL1Q9Y6S9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KL1Q9Y6S9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KL1Q9Y6S9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KL1Q9Y6S9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KL1Q9Y6S9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KL1Q9Y6S9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KL1Q9Y6S9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KL1Q9Y6S9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KL1Q9Y6S9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KL1Q9Y6S9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KL1Q9Y6S9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KL1Q9Y6S9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KL1Q9Y6S9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KL1Q9Y6S9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KL1Q9Y6S9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KL1Q9Y6S9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KL1Q9Y6S9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KL1Q9Y6S9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KL1Q9Y6S9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KL1Q9Y6S9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KL1Q9Y6S9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KL1Q9Y6S9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KL1Q9Y6S9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KL1Q9Y6S9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KL1Q9Y6S9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KL1Q9Y6S9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KL1Q9Y6S9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms