Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G2

PCDHGB2, Protocadherin gamma-B2, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB2Q9Y5G2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDHGB2Q9Y5G2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHGB2Q9Y5G2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHGB2Q9Y5G2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDHGB2Q9Y5G2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHGB2Q9Y5G2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHGB2Q9Y5G2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDHGB2Q9Y5G2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PCDHGB2Q9Y5G2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHGB2Q9Y5G2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHGB2Q9Y5G2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHGB2Q9Y5G2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDHGB2Q9Y5G2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHGB2Q9Y5G2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHGB2Q9Y5G2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHGB2Q9Y5G2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHGB2Q9Y5G2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHGB2Q9Y5G2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHGB2Q9Y5G2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHGB2Q9Y5G2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDHGB2Q9Y5G2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHGB2Q9Y5G2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHGB2Q9Y5G2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHGB2Q9Y5G2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDHGB2Q9Y5G2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHGB2Q9Y5G2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHGB2Q9Y5G2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHGB2Q9Y5G2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHGB2Q9Y5G2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHGB2Q9Y5G2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHGB2Q9Y5G2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHGB2Q9Y5G2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHGB2Q9Y5G2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDHGB2Q9Y5G2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHGB2Q9Y5G2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHGB2Q9Y5G2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHGB2Q9Y5G2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHGB2Q9Y5G2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDHGB2Q9Y5G2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHGB2Q9Y5G2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHGB2Q9Y5G2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHGB2Q9Y5G2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHGB2Q9Y5G2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHGB2Q9Y5G2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHGB2Q9Y5G2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHGB2Q9Y5G2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDHGB2Q9Y5G2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHGB2Q9Y5G2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHGB2Q9Y5G2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHGB2Q9Y5G2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHGB2Q9Y5G2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHGB2Q9Y5G2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHGB2Q9Y5G2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHGB2Q9Y5G2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCDHGB2Q9Y5G2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHGB2Q9Y5G2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHGB2Q9Y5G2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHGB2Q9Y5G2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PCDHGB2Q9Y5G2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHGB2Q9Y5G2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCDHGB2Q9Y5G2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCDHGB2Q9Y5G2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms